Miejsce koronacji i spoczynku królów polskich. Tu znajduje się  Ołtarz Ojczyzny oraz Kaplica Zygmuntowska - dzieło renesansowej architektury i rzeźby.

Komnaty urządzone zostały jako wnętrza renesansowe i barokowe z XVI i początku XVII w. Tutaj znajduje się słynna kolekcja arrasów flamandzkich.

Skarbiec Koronny obejmuje zespół przedmiotów z okresu od XI do XVIII wieku. Znajduje się tu m.in. słynny Szczerbiec - miecz koronacyjny królów polskich.

Wystawa obejmuje rezerwat archeologiczny, lapidarium (zespół detali architektonicznych z XVI wieku) oraz kolekcję kafli renesansowych i barokowych.

Znajdują się tu obiekty związane z kultem religijnym: naczynia i szaty liturgiczne, oraz pamiątki historyczne i przedmioty należące do biskupa Karola Wojtyły.

Wystawa dzieł sztuki Bliskiego i Dalekiego Wschodu. Broń, chorągwie tureckie, ceramika z Chin i Japonii - związane z kampanią wiedeńską i Janem III Sobieskim.

Wielką osobliwością Wzgórza Wawelskiego jest naturalna grota jurajska związana z legendą o smoku wawelskim i księciu Kraku - założycielu Krakowa.

Synagoga Remuh pełni funkcje sakralne dla społeczności żydowskiej. Cmentarz  przy synagodze stanowi najstarszy zachowany w Europie zespół nagrobków żydowskich.

Wystawa w historycznym wnętrzu najstarszej synagogi Krakowa przedstawia bogatą historię i tradycję krakowskich Żydów.

Wystawa w podziemiach Rynku Głównego nawiązuje chronologicznie do początków krakowskiego ośrodka miejskiego ilustrując jego rozwój i przemiany w XIII- XIX w.

W galerii zgromadzono najwybitniejsze dzieła polskiego malarstwa XVIII i XIX w. m. in. J. Matejki, P. Michałowskiego, J. Chełmońskiego.

Jest to jedyne w Krakowie i najstarsze w Polsce muzeum biograficzne poświęcone malarzowi, nazywanemu "autorem wyobraźni zbiorowej Polaków".

Wystawa zorganizowana w pomieszczeniach kamienicy rodziny Szołayskich przy pl. Szczepańskim  ilustruje odrodzoną sztukę polską z przełomu XIX i XX w.

Wystawa ilustruje w ciągłości historycznej dzieje mieszkańców miasta w dramatycznym okresie okupacji niemieckiej (1939-1945).

Wystawa w historycznym wnętrzu najstarszej synagogi Krakowa przedstawia bogatą historię i tradycję krakowskich Żydów.

Zasoby muzeum obejmują przykłady techniki i sztuki japońskiej w całej jej rozciągłości: rzeźbę, malarstwo, elementy ubioru, uzbrojenia itp.

Zwiedzanie miejsc związanych z pobytem i posługą Jana Pawła II w Krakowie. Rozpoczynamy od katedry na Wawelu, kończymy w sanktuarium w Łagiewnikach.